街のあちらこちらで発生する少年少女誘拐事件。次々と誘拐される子供たち。一体子供たちはどこに連れて行かれたのか・・・
この事態を重く見たモリタニ参謀は、地球防衛隊トビヤマ隊長に誘拐事件の捜査を行うように命じた。イコ隊員は、ニイツ隊員と早速公園から捜査することにした。
イコ隊員たちは、手始めに公園に向かった。するとなんと、その公園で誘拐を企てていた男がいたのだ。言葉巧みに子供を連れ出そうとする誘拐犯。それを見たイコ隊員は、誘拐を阻止するために誘拐犯の前に立ちはだかった。誘拐犯の男は観念したかのように見えたが、男はクマのぬいぐるみに変身。変身した男は突如身軽に逃げ回り、イコ隊員たちは振りきられてしまったのだった。
「なんで誘拐犯はクマのぬいぐるみに変身したのでしょう?」イコ隊員は隊長に報告しながらも、疑問に思っていた。
やがて誘拐犯たちの正体が宇宙人で、子供たちに警戒されないようにぬいぐるみの姿で行動していたことを突き止めたイコ隊員。その拠点が遊園地にあるとこも判り、単身敵の基地に乗り込んで子供たちを救い出そうと試みた。ところが宇宙人たちに救出の試みを見破られてしまった。
イコ隊員の救出劇を阻止させるため、宇宙人たちは子供たちのエネルギーを使ってパンダのぬいぐるみを巨大化させた。宇宙人の企みは成功するかのように思えたそのとき、イコ隊員が叫んだ。
「イコ! ジャイアント!!」
巨大化したパンダのぬいぐるみを押さえ込むために、お願いパワーでイコ隊員も巨大化したのだ。形勢逆転した。イコジャイアントが巨大パンダぬいぐるみを押さえつけるのは、時間の問題だ。ところが、イコ隊員優勢と見た宇宙人たちは、今度は卑劣にも子供の一人を人質にしたのだった・・・